Il Museo Pontificio Santa Casa si estende su una superficie di 2000 mq, per complessive 30 sale espositive. I mobili del XVI e XVII secolo, che ornano le sale del Primo piano, costituivano in passato l’arredo d’uso originario del Palazzo.

E' collocato nei piani superiori del braccio occidentale del Palazzo Apostolico, che si articola a sinistra e di fronte alla Basilica, nella Piazza della Madonna, caratterizzato da un imponente porticato e da un loggiato soprastante in bianca pietra d’Istria, d’ordine dorico al pianterreno e ionico al piano superiore.